（1）第一期时，甲箱和乙箱中的全部果蝇是两个区域的，属于两个种群． 　　（2）由图可知实验中表示环境选择的因素主要是食物． 　　（3）由题意知，经过八代更长时间之后再混养时，果蝇的交配择偶出现具有严重的同体色选择偏好，造成两品系果蝇之间可能产生了生殖隔离，属于两个物种，因此可能体现生物多样性的物种多样性． 　　（4）分析甲箱和乙箱的果蝇数量可知，甲的种群数量大，因此甲箱果蝇的种群基因库大，T1、T2、t基因为复等位基因． 　　（5）分析表格中信息可知，E基因频率在不同世代之间的变化不大，最稳定；由表格中信息可知，甲箱中，E的基因频率为65%，则e的基因频率为35%，因此该等位基因杂合体出现的频率是2×65%×35%=45.5%． 　　故答案为： 　　（1）种群      　　（2）食物 　　（3）物种     由于交配的同体色偏好，造成两品系果蝇之间发生生殖隔离现象 　　（4）甲箱        　　（5）E         45.5%